‘정부출연연구기관 등의 설립·운영 및 육성에 관한 법률’에 따라 정부가 출연한 예산으로 운영비와 사업비를 지원하는 연구기관. 과학·기술 분야로는 교육과학기술부의 기초기술연구회 산하에 한국과학기술연구원·한국생명공학연구원 등 13곳, 지식경제부의 산업기술연구회 산하에 한국생산기술연구원·한국식품연구원 등 14곳이 있다. 비과학·기술 분야로는 경제·인문사회연구회 산하에 23곳이 있다.
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